Прародиной коренных американцев, видимо, следует считать Алтай

Международная группа исследователей, в которую входили сотрудники Института цитологии и генетики СО РАН, пришла к выводу, что генетической родиной первых американцев следует считать Алтай. 
Эта сравнительно небольшая гористая область, лежащая на юге Сибири между Россией, Казахстаном, Китаем и Монголией, на протяжении нескольких тысяч лет служила своего рода естественным инкубатором новых народов. Примерно 20–25 тыс. лет назад оттуда, по всей видимости, вышли и предки индейцев (а также, вероятно, чукчей, коряков и др.), расселившиеся по Сибири и в конечном итоге добравшиеся до Америки.

Чорос-Гуркин. Алтайцы-охотники в горах.

Исследователи проанализировали митохондриальные ДНК и Y-хромосомы современных обитателей Алтайского края на наличие маркеров, способных связать их с коренными американцами. Предыдущие этнографические изыскания обнаружили существенные различия между этническими группами северного и южного Алтая: северные, по-видимому, сильнее связаны в языковом и культурном отношении с уральцами и самодийцами, а южные — с бурятами, монголами и уйгурами. 
Кроме того, специалисты обратили внимание на ДНК жителей Южной Сибири, Средней Азии, Монголии, Восточной Азии и, конечно, самих индейцев. Из-за большой выборки результаты, подчёркивают эксперты, можно назвать очень точными. 
В Y-хромосоме южных алтайцев исследователи обнаружили уникальные мутации, присутствующие в ДНК коренных американцев и известные как линия Q. Взгляд с митохондриальной стороны дал аналогичные результаты. «Мы нашли определённые формы гаплогрупп C и D у южных алтайцев и D — у северных, которые выглядят как предки тех генетических типов, которые возникли в Северной Америке, — отмечает ведущий автор исследования Теодор Шурр из Пенсильванского университета (США). — В целом северные алтайцы находятся в более отдалённом родстве с коренными американцами». 
По оценкам специалистов, южная линия алтайцев разошлась с индейцами 13–14 тыс. лет назад. Это соответствует данным археологов, которые полагают, что переселение сибиряков в Америку происходило 15–20 тыс. лет назад. 
Исследователи также показали, что современный культурный разрыв между южными и северными алтайцами имеет древние генетические корни. В то же время анализ митохондриальной ДНК свидетельствует о том, что по женской линии северные и южные алтайцы связаны крепче, чем по мужской. 
Результаты работы опубликованы в издании American Journal of Human Genetics.