В России создан первый в мире электронный депозитарий живых систем

В МГУ имени М.В.Ломоносова заработала информационная система (http://depo.msu.ru/), содержащая данные об образцах из биологических коллекций университета и партнёров проекта "Ноев ковчег" (https://vk.com/vesti.nauka?w=w...).

В мире не существует аналогов подобной системы, позволяющей пользоваться информацией о самых разных биологических образцах.

Исследователи создают для каждого образца подробные паспорта с разносторонней информацией: что это за организм, кем, где и когда он был собран, чем примечателен и для чего его можно использовать в науке и практике.

По словам руководителя направления "Микроорганизмы и грибы" Алексея Соловченко, система станет настоящей базой знаний о живых организмах, хранящихся в депозитарии, поскольку она может хранить не только описание самих организмов, но и все методики работы с ними: как их культивировать, изучать и сохранять долгое время. Это особенно важно для коллекций одноклеточных организмов, таких как бактерии и микроводоросли.

Кроме того, система наделена возможностью автоматической загрузки уже известных сведений о хранящихся организмах из авторитетных международных баз данных - Catalog of Life, NCBI GenBank и другие. Таким образом, паспорт образца может содержать самую разнообразную информацию, вплоть до последовательности генома организма.

Создание такой масштабной электронной системы потребовало строгой упорядоченности образцов, для чего было произведено штрихкодирование: каждый штрих-код нанесен непосредственно на образец. Сфотографировав штрих-код обычным смартфоном, можно за доли секунды найти в базе данных всю доступную информацию об образце и загрузить его паспорт.

Разработчики планируют создать удобный инструментарий для работы с информацией, содержащейся в системе, и внедрить возможность оформления онлайн-заявки для получения биологического материала как внутренним, так и сторонним пользователям.

Число доступных в системе образцов постоянно увеличивается за счёт загрузки новых коллекций и добавления информации из уже имеющихся.

"На данный момент в систему загружено около 510 тысяч образцов, 500 тысяч из которых — гербарные образцы, а около 10 тысяч — подробно охарактеризованные микроорганизмы. Для них, помимо микрофотографий, в систему загружены подробные описания, вплоть до предпочитаемого "меню" и "отпечатков пальцев" - фрагментов последовательностей генома. К концу 2018 года мы планируем загрузить в информационную систему все образцы, которые есть в коллекциях МГУ", — сообщает научный координатор проекта "Ноев ковчег", ведущий научный сотрудник биологического факультета МГУ Пётр Каменский.

Более подробная информация доступна на сайте вуза - http://www.msu.ru/science/main...