Ученые Вашингтонского университета в Сент-Луисе разработали способ спровоцировать клетки делать естественные вещи при неестественных обстоятельствах. По их мнению, это может быть полезно в исследовании стволовых клеток, генной терапии и производства биотоплива и многом другом, так как дает генетикам, можно сказать, революционные возможности.

 

Специалистами был разработан алгоритм, названный NetSurgeon, который рекомендует удаление каких-либо генов (хирургическим путем) из генома клетки, чтобы заставить его выполнять естественную деятельность в иной среде или обстоятельствах. 

 

Например, клетки обыкновенных пекарских дрожжей обычно производят много алкоголя при поглощении сахара, извлеченного из съедобных частей растений кукурузы. С помощью NetSurgeon были разработаны варианты, побудившие клетки производить больше алкоголя при потреблении сахара, содержащегося в несъедобных частях растений.

 

Исследование опубликовано в PNAS Early Edition. Дрожжи были изменены таким образом, чтобы производить алкоголь из ксилозы, путем переработки сахара, поглощенного из  древесных частей растений. Минус пока в том, что эффективность данного процесса не на том уровне, на котором хотелось бы, так как проблема заключается не в том, что модифицированные дрожжи не могут этого делать, а в том, что они «не хотят», отмечают авторы исследования. 

 

Исследовательская группа сосредоточена на поиске транскрипционных регуляторных сетей, управляющих схем, с помощью которых можно влиять на поведение клеток. Ключевыми компонентами этих сетей являются факторы транскрипции (белки, которые включают/выключают гены). NetSurgeon предлагает факторы транскрипции, позволяющие изменить характеристики процессов сообразно поставленным целям путем удаления генов, которые кодируют их.